Metode deteksi dan identifikasi penyebab penyakit dimulai dari kegiatan sterilisasi, pembuatan media biakan, isolasi dan pemurnian mikroorgaisme, serta metode inokulasi pada tanaman. Cara isolasi potagen tanaman dalam media biakan meliputi beberapa cara, demikian juga cara inokulasi pada tanaman dapat dilaksanakan pada bagian tanaman seperti pada batang, daun, maupun tanah.