
Alaidin Koto dilahirkan di Bukittinggi, Sumatera Barat pada 12 Februari 1954. Ia menamatkan pendidikan di Sekolah Dasar Magek, Agam pada 1967. Ia meneruskan pendidikan Tsanawiyah dan Aliyah di Madrasah Tarbiyah Islamiyah Canduang dan lulus pada 1970 dan 1973. Pada 1980, ia meraih gelar Sarjana/Doktorandus dari Jurusan Peradilan Agama Fakultas Syariah Institut Agama Islam Negeri (IAIN) Imam Bonjol Padang. Setelah menjadi dosen, ia meneruskan pendidikan dan meraih gelar Master Islamic Studies konsentrasi Pemikiran Islam dari IAIN Syarif Hidayatullah (Syahid) Jakarta pada 1989. Pada 1996, ia meraih gelar Doktor Islamic Studies konsentrasi pemikiran politik Islam dari IAIN Syahid Jakarta.